Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nell2Q61220 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nell2Q61220 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nell2Q61220 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms