Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms