Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp7Q60973 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms