Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Prdm1Q60636 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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