Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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