Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tdrd5Q5VCS6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tdrd5Q5VCS6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tdrd5Q5VCS6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tdrd5Q5VCS6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tdrd5Q5VCS6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tdrd5Q5VCS6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd5Q5VCS6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tdrd5Q5VCS6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tdrd5Q5VCS6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tdrd5Q5VCS6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tdrd5Q5VCS6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tdrd5Q5VCS6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd5Q5VCS6 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms