Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim38Q5SZ99 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms