Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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