Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Urb1Q571H0 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Urb1Q571H0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urb1Q571H0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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