Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc110Q3V125 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc110Q3V125 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc110Q3V125 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc110Q3V125 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc110Q3V125 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc110Q3V125 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc110Q3V125 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc110Q3V125 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc110Q3V125 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc110Q3V125 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc110Q3V125 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc110Q3V125 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc110Q3V125 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc110Q3V125 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc110Q3V125 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc110Q3V125 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms