Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnpc3Q3UZ01 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms