Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYK3

Tbc1d9, TBC1 domain family member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9Q3UYK3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d9Q3UYK3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms