Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pfdn4Q3UWL8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Pfdn4Q3UWL8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Pfdn4Q3UWL8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pfdn4Q3UWL8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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