Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms