Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc34Q3UI66 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms