Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Rnf40Q3U319 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rnf40Q3U319 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rnf40Q3U319 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rnf40Q3U319 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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