Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Kdm4dQ3U2K5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Kdm4dQ3U2K5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Kdm4dQ3U2K5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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