Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms