Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim24Q0VG18 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms