Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms