Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MestQ07646 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms