Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cxcr5Q04683 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cxcr5Q04683 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cxcr5Q04683 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr5Q04683 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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