Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms