Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Itga4Q00651 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms