Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms