Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Hoxc13P50207 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Hoxc13P50207 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Hoxc13P50207 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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