Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LmnaP48678 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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