Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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