Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtlP38585 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TtlP38585 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
TtlP38585 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TtlP38585 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TtlP38585 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TtlP38585 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TtlP38585 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms