Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms