Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms