Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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