Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms