Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms