Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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