Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms