Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms