Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spi1P17433 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spi1P17433 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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