Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms