Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops6O88545 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops6O88545 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cops6O88545 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cops6O88545 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cops6O88545 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cops6O88545 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cops6O88545 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cops6O88545 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cops6O88545 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cops6O88545 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops6O88545 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cops6O88545 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cops6O88545 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops6O88545 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cops6O88545 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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