Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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