Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Edil3O35474 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms