Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Prrt1O35449 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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