Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Kcns1O35173 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Kcns1O35173 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Kcns1O35173 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Kcns1O35173 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Kcns1O35173 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Kcns1O35173 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Kcns1O35173 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Kcns1O35173 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Kcns1O35173 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Kcns1O35173 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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