Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms