Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm8356J3QPD3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms