Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sclt1G5E861 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms