Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms