Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm20518E9Q548 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm20518E9Q548 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm20518E9Q548 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm20518E9Q548 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm20518E9Q548 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm20518E9Q548 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm20518E9Q548 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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