Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms